MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mesorhizobium loti MAFF303099 chromosome

Total Repeats: 164482

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5502	NC_002678	GAT	2	6	235631	235636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13470586
5503	NC_002678	ATC	2	6	235690	235695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5504	NC_002678	GAA	2	6	235752	235757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5505	NC_002678	TTC	2	6	235781	235786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5506	NC_002678	GCC	2	6	235794	235799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5507	NC_002678	GT	4	8	235826	235833	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5508	NC_002678	AGG	2	6	235840	235845	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5509	NC_002678	GC	3	6	235895	235900	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5510	NC_002678	GAC	2	6	235943	235948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5512	NC_002678	TGA	2	6	236102	236107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5514	NC_002678	CCG	2	6	236154	236159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5515	NC_002678	GT	3	6	236222	236227	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5516	NC_002678	ATG	2	6	236514	236519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13470587
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5518	NC_002678	CGA	3	9	236567	236575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470587
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5523	NC_002678	TAC	2	6	236673	236678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13470587
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5535	NC_002678	CGCGG	2	10	237319	237328	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5536	NC_002678	CGC	2	6	237342	237347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5537	NC_002678	GGTGCG	2	12	237409	237420	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	13470588
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5542	NC_002678	GCC	2	6	237763	237768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5543	NC_002678	TCG	2	6	237792	237797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5545	NC_002678	CATA	2	8	237866	237873	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5546	NC_002678	CGGGG	2	10	237973	237982	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
5547	NC_002678	ACG	2	6	237991	237996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5549	NC_002678	GCTC	2	8	238070	238077	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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5554	NC_002678	CG	4	8	238196	238203	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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5560	NC_002678	CGA	2	6	238647	238652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470589
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5626	NC_002678	TGC	2	6	241324	241329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470591
5627	NC_002678	GAT	2	6	241338	241343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13470591
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5629	NC_002678	TGC	2	6	241472	241477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470591
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5689	NC_002678	CGG	2	6	243997	244002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5745	NC_002678	GCT	2	6	246034	246039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470594
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5747	NC_002678	ACCGA	2	10	246065	246074	40 %	0 %	20 %	40 %	13470594
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5750	NC_002678	GCG	2	6	246208	246213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470594
5751	NC_002678	GAC	2	6	246220	246225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470594
5752	NC_002678	CG	3	6	246227	246232	0 %	0 %	50 %	50 %	13470594
5753	NC_002678	GAA	2	6	246355	246360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13470594
5754	NC_002678	GACC	2	8	246406	246413	25 %	0 %	25 %	50 %	13470594
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5822	NC_002678	GCAC	2	8	249581	249588	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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5873	NC_002678	TGG	2	6	251735	251740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13470599
5874	NC_002678	CGGC	3	12	251805	251816	0 %	0 %	50 %	50 %	13470599
5875	NC_002678	GCCGA	2	10	251825	251834	20 %	0 %	40 %	40 %	13470599
5876	NC_002678	GCCG	2	8	251873	251880	0 %	0 %	50 %	50 %	13470599
5877	NC_002678	TCG	2	6	251910	251915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470599
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5881	NC_002678	GC	3	6	252017	252022	0 %	0 %	50 %	50 %	13470599
5882	NC_002678	CGTAC	2	10	252025	252034	20 %	20 %	20 %	40 %	13470599
5883	NC_002678	TGT	2	6	252060	252065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	13470599
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5885	NC_002678	CGT	2	6	252121	252126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470599
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5903	NC_002678	GGCCGA	2	12	252946	252957	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
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5905	NC_002678	CGC	2	6	252993	252998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5906	NC_002678	GCC	3	9	253018	253026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5985	NC_002678	TCCGGA	2	12	256701	256712	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	13470604
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5987	NC_002678	CCTTGA	2	12	256780	256791	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	13470604
5988	NC_002678	CGG	3	9	256819	256827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470604
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5990	NC_002678	CGG	2	6	256846	256851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470604
5991	NC_002678	TCT	2	6	257008	257013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5992	NC_002678	TCA	2	6	257348	257353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13470605
5993	NC_002678	AT	3	6	257371	257376	50 %	50 %	0 %	0 %	13470605
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5996	NC_002678	ACCGC	2	10	257599	257608	20 %	0 %	20 %	60 %	13470605
5997	NC_002678	TGG	2	6	257722	257727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13470606
5998	NC_002678	GGC	2	6	257780	257785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470606
5999	NC_002678	GAA	2	6	257798	257803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13470606
6000	NC_002678	GCC	3	9	257804	257812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470606

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